4、專項資金是否按特定項目或用途專款專用，有無擠占或虛列行為。
5、支出的會計核算是否合規、準確。有無利用應收及暫付、應付及暫存、代管項目等過渡性會計科目掛賬隱瞞支出或直接列收列支等問題。
6、支出預算中是否有保證預算目標實現的控制措施和辦法。
7、分析支出預算的執行情況與支出預算之間的差異和原因。
8、分析與評價支出預算執行的效益和效果。
（四）審計方法
支出預算執行審計可以采用調查、審核、監盤、觀察、函證、計算、分析性復核、抽樣和詢問等方法。

第三節 決算審計
第六十四條 決算審計是對決算報表及其資產、負債、凈資產、收入和支出進行的審查和評價。
第六十五條 決算報表審計
決算報表審計是對決算報表的真實性、合法性和完整性進行審查和評價。
（一）應獲取的相關資料
主要包括年度預算及其編制與調整說明和批準文件，包括上級主管部門批準的年度預算通知和預算追加調整通知；年度財務決算報表及其編制說明和上級主管部門關于年度決算編報的通知；年度會計賬簿、會計憑證及有關的重要經濟合同協議、會議記錄等資料；學校國有資產處置（包括固定資產與存貨的報廢、轉作投資、無償調撥、毀損、丟失和壞賬處理等）的審批文件和相關資料；其他有關資料。
（二）應關注的風險領域
主要包括報表存在不合法項目的風險、收入和支出中存在不真實項目的風險、支出標準不合規定的風險、專項經費未專款專用的風險、支出核算不正確的風險等。
（三）審計內容
1、審查財務決算報表是否完整，并進行復核性檢查。包括：財務決算報表是否齊全，符合上級主管部門的統一要求；每張報表內容填列是否完整、正確；項目填列是否齊全，表內對應項目之間數據勾稽關系是否正確，應當填寫的“報表附注”是否填列；對應報表之間數據勾稽關系是否正確；是否有年度財務情況說明（文字部分）；是否按有關規定簽名蓋章。
2、核對報表項目數據填列與對應的賬戶余額或發生額是否一致，檢查表、賬是否相符。按照報表所列項目，逐一與會計賬簿進行核對。
3、對報表項目內容的真實性進行檢查驗證，應用預算執行審計成果對收入、支出類項目進行分析性復核；檢查各項資產的實有數與報表填列數是否一致；審查各項凈資產的形成過程，分別進行驗算。