大手筆地修訂體現在對原條列相關的四個條款的改寫上：第一個修訂，是新法給出了“應納稅額”名副其實的解釋。用公式表述為： 應納稅稅額＝收入總額－不征稅收入－免稅收入－各項扣除金額－允許彌補的以前年度虧損金額。修改了條列所稱的“收入總額減去準予扣除項目的余額”即為應納 稅所得額的明顯不能自圓其說的表述。第二個修訂，是對“收入總額”的范圍和內容進行了增補、分解、規范。一是增加了收入總額包括“以貨幣形式和非貨幣形式 從各種來源取得的收入”；二是將“生產、經營收入”分解為“銷售貨物收入”和“提供勞務收入”兩類，與增值稅和營業稅相對應；三是將“租賃收入”和“股息 收入”分別改稱為“租金收入”和“股息、紅利等權益性投資收益”；四是新增了“接受捐贈收入”一項。保留了原單列的“轉讓財產收入”、“特許權使用費收 入”、“利息收入”和“其他收入。第三個修訂，是對不得在稅前扣除的項目進行了大幅度地變革。體現在“三增”、“兩合”和“三剔除”。增加了“向投資者支 付的股息、紅利等權益性投資收益款項”、“企業所得稅稅款”和“未經核定的準備金支出”三個項目；將原“違法經營的罰款和被沒收財物的損失”和“各項稅收 的滯納金、罰金和罰款”兩項整合分解為“稅收滯納金”與“罰金、罰款和被沒收財物的損失”；剔除了“資本性支出”、“無形資產受讓、開發支出”和“自然災 害或者意外事故損失有賠償的部分”三類支出。此外，將原“超過國家規定允許扣除的公益、救濟性的捐贈,以及非公益、救濟性的捐贈”的表述統一規范歸結為 “本法第九條規定以外的捐贈支出”。只保留了贊助支出和與取得收入無關的其他支出兩個不得稅前扣除的款項。使不得扣除的項目在項數雖然仍然為八個，內容卻 發生了很大變化。第四個修訂，反映在對納稅年度發生的虧損的處理上。新法一方面明確了“準予虧損結轉”的地位。不允許其將虧損結轉，何談彌補？一方面用限 制最長結轉年限來替代彌補期之說。這樣的修訂，不僅合乎實際，而且也消除了原條例表述不嚴密的問題。
在應納稅所得額的規范上，僅有三個條 款。其中，第二十二條關于應納稅所得額的概念性地表述，與條例比較，屬于新增條款。第二十三條和第二十四條應屬對原條例第十二條的修訂。對于來源于境外所 得已繳納所得稅款的處理，新法首先將“扣除”改稱為“抵免”。邏輯更嚴密。其次，對超過規定的抵免限額的部分首次明確為：可以在以后五個年度內，用每年度 抵免限額抵免當年應抵稅額后的余額進行抵補。同時，采取列舉式指明了可享受抵免的對象，包括居民企業來源于中國境外的應稅所得和非居民企業在中國境內設立 機構、場所，取得發生在中國境外但與該機構、場所有實際聯系的應稅所得。第三、將“居民企業從其直接或者間接控制的外國企業分得的來源于中國境外的股息、 紅利等權益性投資收益”問題作為特例，用一個獨立的條款（第二十四條）予以明確。即，可以抵免境外所得稅稅額的前提是該項所得已經在境外繳納了所得稅稅 額。否則不能享受第二十三條的規定的抵免政策。