對于股權激勵的會計處理問題，財政部2006年頒布的《企業會計準則第11號——股份支付》已經作出規范。實施股權激勵的上市公司在2006年后，都按照該準則進行了會計處理。但是，對于股權激勵的企業所得稅如何處理一直沒有明確的規定。實際上，缺少對股權激勵企業所得稅處理的明確規定，上市公司對于股權激勵的會計處理也是不完整的，上市公司對于股權激勵無法按照《企業會計準則第18號——所得稅》規定的原則進行所得稅會計處理，從而導致披露的報表不準確。
　　股權激勵的會計和稅務處理
　　近日，國家稅務總局發布《關于我國居民企業實行股權激勵計劃有關企業所得稅處理問題的公告》(國家稅務總局公告2012年第18號)，明確了我國對于股權激勵企業所得稅的處理原則。公告規定，上市公司依照管理辦法要求建立職工股權激勵計劃，并按我國企業會計準則的有關規定，在股權激勵計劃授予激勵對象時，按照該股票的公允價格及數量，計算確定作為上市公司相關年度的成本或費用，作為換取激勵對象提供服務的對價。上述企業建立的職工股權激勵計劃，其企業所得稅的處理，按以下規定執行：
　　(一)對股權激勵計劃實行后立即可以行權的，上市公司可以根據實際行權時該股票的公允價格與激勵對象實際行權支付價格的差額和數量，計算確定作為當年上市公司工資、薪金支出，依照稅法規定進行稅前扣除。
　　(二)對股權激勵計劃實行后，需待一定服務年限或者達到規定業績條件(以下簡稱等待期)方可行權的，上市公司等待期內會計上計算確認的相關成本費用，不得在對應年度計算繳納企業所得稅時扣除。在股權激勵計劃可行權后，上市公司方可根據該股票實際行權時的公允價格與當年激勵對象實際行權支付價格的差額及數量，計算確定作為當年上市公司工資、薪金支出，依照稅法規定進行稅前扣除。
　　(三)本條所指股票實際行權時的公允價格，以實際行權日該股票的收盤價格確定。
　　對比國家稅務總局公告2012年第18號和《企業會計準則第11號——股份支付》的規定，可以看出稅法和會計準則對于股權激勵的處理存在明顯差異：
　　《企業會計準則第11號——股份支付》規定，除了立即可行權的股份支付外，無論是權益結算的股份支付還是現金結算的股份支付，企業在授予日均不做會計處理。企業應當在等待期內的每個資產負債表日，將取得職工或其他方提供的服務計入成本費用，同時確認所有者權益或負債。對于附有市場條件的股份支付，只要職工滿足了其他所有非市場條件，企業就應當確認已經取得的服務。