2.對單位和個人在本通知實施之前開始繳付年金繳費，個人在本《通知》實施之后領取年金的，允許其從領取的年金中減除在本通知實施之前繳付的年金單位繳費和個人繳費且已經繳納個人所得稅的部分，就其余額按照本通知第三條第1項的規定征稅。在個人分期領取年金的情況下，可按本通知實施之前繳付的年金繳費金額占全部繳費金額的百分比減計當期的應納稅所得額，減計后的余額，按照本通知第三條第1項的規定，計算繳納個人所得稅。其計算公式為：應納稅額=(每月領取額-已經繳納個稅的繳費部分)×適用稅率-速算扣除數。
　　3.對個人因出境定居而一次性領取的年金個人賬戶資金，或個人死亡后，其指定的受益人或法定繼承人一次性領取的年金個人賬戶余額，允許領取人將一次性領取的年金個人賬戶資金或余額按12個月分攤到各月，就其每月分攤額，按照規定計算繳納個人所得稅。對個人除上述特殊原因外，一次性領取年金個人賬戶資金或余額的，則不允許采取分攤的方法，而是就其一次性領取的總額，單獨作為一個月的工資薪金所得，計算繳納個人所得稅。其計算公式為：應納稅額=一次性領取的總額×適用稅率-速算扣除數。
　　補充養老保險允許在企業所得稅稅前扣除
　　本次“通知”未涉及補充養老保險，補充養老保險仍按現有法規執行。依據《企業所得稅法實施條例》第三十五條規定，企業為投資者或者職工支付的補充養老保險費、補充醫療保險費，在國務院財政、稅務主管部門規定的范圍和標準內，準予扣除。
　　根據《補充養老保險費補充醫療保險費有關企業所得稅政策問題》(財稅[2009]27號)的規定，企業根據國家有關政策規定，為在本企業任職或者受雇的全體員工支付的補充養老保險費，分別在不超過職工工資總額5%標準內的部分，在計算應納稅所得額時準予扣除;超過的部分，不予扣除。
　　個人領取年金時應納稅款由受托人代扣代繳
　　通常情況下，個人取得所得由支付所得單位負責代扣代繳個人所得稅。也就是說，哪個單位支付了所得，就由哪個單位負責扣繳稅款。
　　個人領取年金時，其應納稅款由受托人代表委托人委托托管人代扣代繳。年金賬戶管理人應及時向托管人提供個人年金繳費及對應的個人所得稅納稅明細。托管人根據受托人指令及賬戶管理人提供的資料，按照規定計算扣繳個人當期領取年金待遇的應納稅款，并向托管人所在地主管稅務機關申報解繳。
　　就年金所得來看，企業年金、職業年金涉及納稅義務主要集中在繳費和領取兩個環節。在年金繳費環節，由個人所在單位在其繳費時，對超出免稅標準的部分隨同當月工資、薪金所得一并計算代扣個人所得稅，并向其所在單位主管稅務機關申報繳納;在年金領取環節，由托管人在為個人支付年金待遇時，根據個人當月取得的年金所得、往期繳費及納稅情況計算扣繳個人所得稅，并向托管人主管稅務機關申報繳納。