1.資(zi)(zi)料(liao)受理(li)。主(zhu)管稅務機關(guan)(guan)接(jie)到企(qi)業(ye)的(de)年度(du)所得稅納(na)稅申報(bao)表(biao)和有關(guan)(guan)資(zi)(zi)料(liao)后，應檢查企(qi)業(ye)報(bao)送的(de)資(zi)(zi)料(liao)是否齊全，如(ru)發(fa)現企(qi)業(ye)未按規定報(bao)齊有關(guan)(guan)附表(biao)、文(wen)件等資(zi)(zi)料(liao)，應責令(ling)限(xian)期補齊；對填報(bao)項目不完整(zheng)的(de)，應退(tui)回企(qi)業(ye)并責令(ling)限(xian)期補正。 

　　2.資料審核。對企業報送的有關(guan)(guan)資料，主管稅(shui)務機(ji)關(guan)(guan)應就以下幾個方面內容進行審核：

　　(1)企(qi)業年度(du)所得稅(shui)納稅(shui)申報(bao)(bao)表及(ji)其(qi)附表與年度(du)財(cai)務會計報(bao)(bao)告的數字是(shi)否一致，各項目之間(jian)的邏輯關系(xi)是(shi)否對(dui)應，計算是(shi)否正確。

　　(2)企(qi)業是否按(an)規定(ding)結轉或彌補以前年(nian)度虧損額(e)。

　　(3)企業是否(fou)符合稅收(shou)減免條件。

　　(4)企(qi)(qi)業在中國境內設立兩個或(huo)者兩個以上機(ji)構、場(chang)所(suo)，選擇由其主要機(ji)構、場(chang)所(suo)匯總繳納企(qi)(qi)業所(suo)得稅(shui)的(de)，是(shi)否經稅(shui)務機(ji)關審核批準，以及(ji)各機(ji)構、場(chang)所(suo)賬表所(suo)記載涉及(ji)計算應(ying)納稅(shui)所(suo)得額的(de)各項(xiang)數據是(shi)否準確(que)。

　　(5)企業有來源于中國境(jing)外的應納稅(shui)所得額(e)的，境(jing)外所得應補企業所得稅(shui)額(e)是否正確。

　　(6)企業(ye)已(yi)預繳稅款填寫是(shi)否正確(que)。 

　　3.結(jie)清稅款。主管稅務機關(guan)應(ying)結(jie)合季(ji)度所得稅申(shen)報(bao)(bao)表及日常征管情況，對企業(ye)報(bao)(bao)送(song)的(de)年(nian)度申(shen)報(bao)(bao)表及其附表和(he)其他有關(guan)資料進行初步審(shen)核(he)，在5月31日前，對應(ying)補(bu)(bu)繳所得稅、應(ying)辦理退稅的(de)企業(ye)發送(song)《非居(ju)民企業(ye)所得稅匯算清繳涉稅事(shi)宜通知書》，并辦理稅款多退少補(bu)(bu)事(shi)宜。

　　4.實施處罰。主管稅(shui)務機(ji)關對企(qi)業未按《辦法》規定(ding)辦理(li)年度所得稅(shui)申報，應按照規定(ding)實施處罰；必要時發送《非居民企(qi)業所得稅(shui)應納(na)稅(shui)款(kuan)核(he)定(ding)通知(zhi)書(shu)》，核(he)定(ding)企(qi)業年度應納(na)稅(shui)額，責令其繳(jiao)納(na)。 

　　5.匯(hui)總申報(bao)協調。

　　(1)匯(hui)繳(jiao)機構所在地(di)主管稅務機關在接受(shou)企業(ye)年度所得稅匯(hui)總申報(bao)后，應于(yu)5月31日(ri)前(qian)為企業(ye)出(chu)具《非居民企業(ye)匯(hui)總申報(bao)所得稅證(zheng)明》。 

　　(2)匯繳(jiao)機(ji)(ji)(ji)構(gou)所在地主(zhu)管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)(ji)(ji)關(guan)對(dui)企業的匯總申(shen)報資(zi)料(liao)進(jin)行審(shen)核時，對(dui)其(qi)他機(ji)(ji)(ji)構(gou)的情況有疑問需要(yao)進(jin)一步審(shen)核的，可以向其(qi)他機(ji)(ji)(ji)構(gou)所在地主(zhu)管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)(ji)(ji)關(guan)發(fa)送《非居民企業匯總申(shen)報納稅事項(xiang)協查(cha)(cha)函》(見附件(jian)1)，其(qi)他機(ji)(ji)(ji)構(gou)所在地主(zhu)管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)(ji)(ji)關(guan)應負(fu)責(ze)就協查(cha)(cha)事項(xiang)進(jin)行調查(cha)(cha)核實，并將結果函復匯繳(jiao)機(ji)(ji)(ji)構(gou)所在地主(zhu)管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)(ji)(ji)關(guan)。 

　　(3)其他(ta)機(ji)構所(suo)(suo)在(zai)地主管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)關(guan)(guan)在(zai)日常管(guan)理(li)或稅務(wu)(wu)檢查中(zhong)，發現其他(ta)機(ji)構有(you)少計(ji)收入或多列成本費用等所(suo)(suo)得稅的問(wen)題，應將有(you)關(guan)(guan)情況及時向匯繳(jiao)機(ji)構所(suo)(suo)在(zai)地主管(guan)稅務(wu)(wu)機(ji)關(guan)(guan)發送《非居民(min)企業(ye)匯總申報納稅事項(xiang)處理(li)聯(lian)絡函》(見附件2)。 

　　(4)其他機構所在地主管稅務機關按照《辦法》規定對其他機構就地征收稅款或調整虧損額的，應及時將征收稅款及應納稅所得額調整額以《非居民企業匯總申報納稅事項處理聯絡函》通知匯繳機構所在地主管稅務機關，匯繳機構所在地主管稅務機關應對企業應納稅所得額及應納稅總額作相應調整，并在應補(退)稅額中減除已在其他機構所在地繳納的稅款。