通過納(na)稅(shui)(shui)調(diao)整將不(bu)征(zheng)稅(shui)(shui)收入(ru)(ru)(ru)及其(qi)形成(cheng)的(de)支(zhi)出(chu)從應(ying)(ying)納(na)稅(shui)(shui)所(suo)得額(e)中分離出(chu)來(lai)，再將免(mian)稅(shui)(shui)收入(ru)(ru)(ru)、減計(ji)(ji)收入(ru)(ru)(ru)以及減征(zheng)、免(mian)征(zheng)所(suo)得額(e)項(xiang)目從收入(ru)(ru)(ru)總(zong)額(e)中剔除，在此基礎上(shang)，將應(ying)(ying)稅(shui)(shui)收入(ru)(ru)(ru)與(yu)成(cheng)本、費用、稅(shui)(shui)金、損失和其(qi)他支(zhi)出(chu)按照(zhao)稅(shui)(shui)法口徑匹(pi)配，計(ji)(ji)算應(ying)(ying)納(na)稅(shui)(shui)所(suo)得額(e)，進而計(ji)(ji)算應(ying)(ying)納(na)稅(shui)(shui)額(e)或(huo)結轉虧損的(de)數額(e)。不(bu)征(zheng)稅(shui)(shui)收入(ru)(ru)(ru)和免(mian)稅(shui)(shui)收入(ru)(ru)(ru)、減計(ji)(ji)收入(ru)(ru)(ru)以及減征(zheng)、免(mian)征(zheng)所(suo)得額(e)項(xiang)目與(yu)企業虧損無關(guan)。

    無論免稅(shui)項目(mu)(mu)所得還是(shi)不征稅(shui)項目(mu)(mu)所得，都不可以彌補以前年度虧損。應稅(shui)項目(mu)(mu)與免稅(shui)項目(mu)(mu)（包括不征稅(shui)項目(mu)(mu)）不能互相調劑(ji)補虧。

既(ji)然(ran)不征稅(shui)收入與企業(ye)虧損無關(guan)，因此，假使存在虧損，不征稅(shui)收入仍然(ran)不能用于彌補虧損。

    不征(zheng)稅(shui)收入改變用(yong)途，其對(dui)應支出不能稅(shui)前扣(kou)除(chu)

    財(cai)政(zheng)部(bu)、國(guo)(guo)家(jia)稅務(wu)(wu)總局(ju)關于(yu)進一(yi)步鼓勵軟(ruan)件產(chan)(chan)業(ye)和集成電路產(chan)(chan)業(ye)發(fa)(fa)展企(qi)(qi)業(ye)所得(de)(de)稅政(zheng)策(ce)的通(tong)(tong)(tong)知(zhi)(zhi)（財(cai)稅﹝2012﹞27號）規(gui)定(ding)，符合條件的軟(ruan)件企(qi)(qi)業(ye)按照《財(cai)政(zheng)部(bu)、國(guo)(guo)家(jia)稅務(wu)(wu)總局(ju)關于(yu)軟(ruan)件產(chan)(chan)品增(zeng)值(zhi)稅政(zheng)策(ce)的通(tong)(tong)(tong)知(zhi)(zhi)》（財(cai)稅﹝2011﹞100號）規(gui)定(ding)取(qu)得(de)(de)的即征即退增(zeng)值(zhi)稅款，由企(qi)(qi)業(ye)專項用(yong)于(yu)軟(ruan)件產(chan)(chan)品研發(fa)(fa)和擴大再生產(chan)(chan)并單獨進行(xing)核(he)算(suan)(suan)，可以作為不征稅收(shou)入，在(zai)計算(suan)(suan)應納稅所得(de)(de)額(e)時從收(shou)入總額(e)中減除。《財(cai)政(zheng)部(bu)、國(guo)(guo)家(jia)稅務(wu)(wu)總局(ju)關于(yu)核(he)電行(xing)業(ye)稅收(shou)政(zheng)策(ce)有(you)關問題的通(tong)(tong)(tong)知(zhi)(zhi)》（財(cai)稅﹝2008﹞38號）規(gui)定(ding)，自2008年1月1日起，核(he)力發(fa)(fa)電企(qi)(qi)業(ye)取(qu)得(de)(de)的增(zeng)值(zhi)稅退稅款，專項用(yong)于(yu)還本付息(xi)，不征收(shou)企(qi)(qi)業(ye)所得(de)(de)稅。

    財稅(shui)(shui)﹝2012﹞27號對軟(ruan)件企(qi)(qi)業取得(de)的(de)(de)即征即退增值稅(shui)(shui)款作為不(bu)征稅(shui)(shui)收入(ru)，只(zhi)能用(yong)于軟(ruan)件產品開發和擴(kuo)大(da)再生產，并且單獨(du)核算，否(fou)則，軟(ruan)件企(qi)(qi)業取得(de)的(de)(de)退稅(shui)(shui)款，須并入(ru)應納稅(shui)(shui)所得(de)額，計(ji)算繳納企(qi)(qi)業所得(de)稅(shui)(shui)，對應的(de)(de)支(zhi)出不(bu)能在企(qi)(qi)業所得(de)稅(shui)(shui)前扣除。

    財稅(shui)(shui)﹝2008﹞38號文(wen)件(jian)對核電行(xing)業(ye)收到的(de)增(zeng)(zeng)值稅(shui)(shui)退稅(shui)(shui)款作為不征稅(shui)(shui)收入，只能用于還本付息，并且單(dan)獨核算(suan)，否則，核電行(xing)業(ye)收到的(de)增(zeng)(zeng)值稅(shui)(shui)退稅(shui)(shui)款，須并入應(ying)納稅(shui)(shui)所(suo)(suo)得(de)額，計算(suan)繳納企業(ye)所(suo)(suo)得(de)稅(shui)(shui)，對應(ying)的(de)支(zhi)出(chu)不能在企業(ye)所(suo)(suo)得(de)稅(shui)(shui)前扣除。

    值得注意的是，稅法(fa)明(ming)文規(gui)定(ding)的不征稅收(shou)入在(zai)特殊情況下可(ke)轉(zhuan)化成應(ying)稅收(shou)入，其對應(ying)的支出(chu)可(ke)以在(zai)稅前扣除。

    形(xing)成的研發支出和無形(xing)資(zi)產攤銷(xiao)不(bu)允(yun)許稅前扣(kou)除

    國家稅(shui)(shui)務總局關于印發(fa)《企業(ye)研究開(kai)發(fa)費(fei)用(yong)(yong)稅(shui)(shui)前扣除管理(li)辦法(fa)（試(shi)行）》的(de)通知（國稅(shui)(shui)發(fa)﹝2008﹞116號）第七條規定(ding)，研發(fa)費(fei)用(yong)(yong)計(ji)入當期損(sun)益未形(xing)成無形(xing)資產(chan)的(de)，允許再按(an)其當年(nian)(nian)(nian)研發(fa)費(fei)用(yong)(yong)實際發(fa)生(sheng)額的(de)50%，直(zhi)接抵扣當年(nian)(nian)(nian)的(de)應(ying)納稅(shui)(shui)所(suo)得額；研發(fa)費(fei)用(yong)(yong)形(xing)成無形(xing)資產(chan)的(de)，按(an)照該無形(xing)資產(chan)成本的(de)150%在稅(shui)(shui)前攤銷。除法(fa)律(lv)另有(you)規定(ding)外，攤銷年(nian)(nian)(nian)限不(bu)得低于10年(nian)(nian)(nian)。

    從該通知附件“研發(fa)項(xiang)目可加計扣(kou)除研究(jiu)開發(fa)費(fei)用情(qing)況歸集表”中看，國家稅(shui)(shui)務總局規定將(jiang)企(qi)業收到的專項(xiang)撥款單獨列(lie)示，是(shi)(shi)充分(fen)考(kao)慮到企(qi)業收到資(zi)金(jin)進入(ru)資(zi)金(jin)池(chi)后，無法(fa)區分(fen)此類資(zi)金(jin)形(xing)(xing)成的支(zhi)出(chu)哪些(xie)是(shi)(shi)征(zheng)(zheng)稅(shui)(shui)收入(ru)形(xing)(xing)成的，哪些(xie)不是(shi)(shi)征(zheng)(zheng)稅(shui)(shui)收入(ru)形(xing)(xing)成的，但為了計算(suan)和(he)填表簡化，將(jiang)收到的撥款視同形(xing)(xing)成了等(deng)額的支(zhi)出(chu)，在計算(suan)加計扣(kou)除時從中扣(kou)減。

    《財政部、國(guo)家稅務總局(ju)關(guan)(guan)于中(zhong)關(guan)(guan)村(cun)、東湖、張江國(guo)家自主創新試點地區(qu)和合(he)蕪蚌自主創新綜(zong)合(he)試驗區(qu)有關(guan)(guan)研究開發(fa)費(fei)加計扣(kou)(kou)除試點政策的通知(zhi)》（財稅﹝2013﹞13號）附件“研發(fa)項目可加計扣(kou)(kou)除研究開發(fa)費(fei)用情(qing)況歸集表”中(zhong)，仍(reng)然繼承了《企業所(suo)得稅法》及其(qi)實施(shi)條例和國(guo)稅發(fa)﹝2008﹞116號文不(bu)征稅收入形成的支出不(bu)能(neng)稅前扣(kou)(kou)除的精(jing)髓。

    另外，企業(ye)(ye)取(qu)得的(de)財政撥(bo)款等不征稅(shui)收入形成的(de)研究開發支(zhi)出(chu)，是(shi)國家支(zhi)持企業(ye)(ye)創新給予(yu)的(de)財力物力支(zhi)持，是(shi)與(yu)企業(ye)(ye)正常生產經營活動無(wu)關的(de)支(zhi)出(chu)，不能在企業(ye)(ye)所得稅(shui)前扣(kou)除，更不能加計扣(kou)除。