相對于“時間滯后、職能弱化、訴訟增多”的對工程造價的事后審計來講，越來越多的建設項目跟蹤審計已成為防止投入資金浪費、造成既成事實事后無法 糾正局面的可行手段，但是對于審計也帶來極大的風險。為使置身建設過程中審計機關發表客觀、公正的審計建議及評價，必須重點把握住以下幾個方面：
    1、 跟蹤審計不能參與建設過程中的項目管理
    在跟蹤審計模式下，審計成為建設過程中的一個主要控制環節，審計人員頻繁地介入建設現場進行審計， 提出審計建議，履行審計監督的職責，促進被審計單位糾正和改進工作。但是這一審計模式很容易使審計人員偏離正確的定位而侵入項目管理者的職責范圍，從而造 成審計工作不應有的越位與缺位，使監督的作用弱化，從審計獨立性的角度來說，這是不恰當的。由于介入了項目管理，會產生利益沖突，因而客觀性受損，審計風 險加大。
    2、穩妥推進、量力而行應成為審計機關堅持的原則
    由于跟蹤審計相對于投資項目概（預）算執行情況和竣工決算的審 計，涉及的建設項目資金管理鏈條更長，審計人員需要的知識范圍更寬，但是由于審計人員水平的欠缺，易出現實踐操作不熟練或者出現失誤，使審計的客觀、公正 性受到質疑，從而形成審計風險。因此一方面審計機關在開展建設項目跟蹤審計的過程中，必須遵循“積極探索、穩妥推進、量力而行、力所能及”的原則，要根據 自己的情況和能力安排，這樣才能防范和規避審計風險。另一方面加大引進工程技術人員進入審計機關的力度，達到充實審計技術力量，調整審計人員知識結構，提 升審計機關建設項目審計能力的目的。
    3、聘請外部專家參與審計過程中較專業的內容的審核
    在當(dang)前新工藝、新技(ji)術(shu)層出不(bu)窮的(de) 情況下，高質(zhi)量(liang)(liang)地(di)開展(zhan)好建設項目審計(ji)工作(zuo)的(de)一個可(ke)借(jie)鑒的(de)方(fang)(fang)法就(jiu)是借(jie)力于“外腦”，也就(jiu)是聘(pin)請外部專(zhuan)(zhuan)家。這樣一方(fang)(fang)面避免了審計(ji)在自己(ji)所(suo)不(bu)熟悉、或不(bu)專(zhuan)(zhuan)業的(de)領 域發(fa)表錯(cuo)誤意見的(de)可(ke)能(neng)(neng)性(xing)，規避了審計(ji)風險的(de)產(chan)生，使(shi)審計(ji)的(de)建議更(geng)具專(zhuan)(zhuan)業性(xing)；另一方(fang)(fang)面使(shi)有(you)限(xian)的(de)審計(ji)力量(liang)(liang)，投入到更(geng)能(neng)(neng)發(fa)揮自己(ji)水平的(de)地(di)方(fang)(fang)。所(suo)需把握(wo)的(de)就(jiu)是，在 聘(pin)用(yong)專(zhuan)(zhuan)家的(de)相關合同條(tiao)款中，對專(zhuan)(zhuan)家的(de)工作(zuo)質(zhi)量(liang)(liang)加以約束，以實現審計(ji)風險的(de)全方(fang)(fang)位控制。