動漫企業這張“稅收優惠證書”也并不是“一勞永逸”的。首先，根據財稅65號文中規定，動漫企業的相關稅收優惠政策適用期間為2009年1月1日至2010年12月31日。其次，動漫企業認定實行年審制度。
已取得“動漫企業證書”的動漫企業生產的動漫產品符合規定標準的，可向動漫企業認定辦公室提交相關材料，提出申請認定為重點動漫產品，材料內容包括重點動漫產品認定申請書、企業營業執照副本復印件、稅務登記證復印件、“動漫企業證書”復印件、經具有資質的中介機構鑒證的企業財務年度報表（含資產負債表、損益表、現金流量表）等企業經營情況，并附每項產品銷售收入的情況說明；獲獎證明復印件或版權出口貿易合同復印件等版權出口收入證明和有關機構的推薦證明以及認定機構要求出具的其他材料。符合條件的企業經審核能夠認定為“重點動漫產品”或是“重點動漫企業”。重點動漫產品、重點動漫企業優先享受國家及地方各項財政資金、信貸等方面的扶持政策。經認定的動漫企業、重點動漫企業，憑本年度有效的“動漫企業證書”、“重點動漫企業證書”，以及本年度自主開發生產的動漫產品列表、“重點動漫產品文書”，向主管稅務機關申請享受《通知》規定的有關稅收優惠政策。
動漫企業認定實行年審制度即動漫企業各級認定機構對已認定并發證的動漫企業、重點動漫企業進行年審，并對年度認定合格的企業在證書和年度自主開發生產的動漫產品列表上加蓋年審專用章。被認定為動漫企業的納稅人有義務在規定時間內提出年審申請，不提出年審申請或年度認定不合格的企業，其動漫企業、重點動漫企業資格到期自動失效。對動漫企業的年審情況、年度認定合格及不合格企業名單動漫企業認定辦公室都會備案，并對外公布。動漫企業對年審結果有異議的，可在公布后20個工作日內，向辦公室提出復核申請。但重點動漫企業通過認定辦公室年審后，不需再由省級認定機構進行年審。
另外，根據規定經認定的動漫企業經營活動發生變化（如更名、調整、分立、合并、重組等）的，應在15個工作日內，向原發證單位辦理變更手續，變化后不符合本辦法規定標準的，省級認定機構應報辦公室審核同意后，撤銷其“動漫企業證書”，終止其資格。不符合本辦法規定標準的重點動漫企業，由辦公室直接撤銷其"重點動漫企業證書"，終止其資格。動漫企業更名的，原認定機構為其辦理變更手續后，重新核發證書，編號不變。
準確解讀相關稅收優惠政策對動漫企業享受稅收優惠提供了保障，隨時了解相關政策導向和后續管理政策，是企業維護自身稅收權益并爭取最大稅收優惠所必須的，國家對動漫產業的空前扶持力度使得納稅人關注這一方面信息顯得尤為重要。