第八條 對屬于增值稅一般納稅人的研發機構的退稅申請，主管退稅稅務機關須在增值稅專用發票稽核信息核對無誤的情況下，辦理退稅。對非增值稅一般納稅人研發機構的退稅申請，主管退稅稅務機關須進行發函調查，在確認發票真實、發票所列設備已按照規定申報納稅后，方可辦理退稅。
第九條 采購國產設備的應退稅額，按照增值稅專用發票上注明的稅額確定。凡企業未全額支付所購設備貨款的，按照已付款比例和增值稅專用發票上注明的稅額確定應退稅款；未付款部分的相應稅款，待企業實際支付貨款后再予退稅。
第十條 主管退稅稅務機關對已辦理退稅的增值稅專用發票應加蓋“已申報退稅”章，留存或退還企業并按規定保存，企業不得再作為進項稅額抵扣憑證。
第十一條 主管退稅稅務機關應對研發機構采購國產設備退稅情況建立臺賬（紙質或電子）進行管理。
第十二條 研發機構已退稅的國產設備，由主管退稅稅務機關進行監管，監管期為5年。監管期內發生設備所有權轉移行為或移作他用等行為的，研發機構須按以下計算公式，向主管退稅稅務機關補繳已退稅款。
應補稅款=增值稅專用發票上注明的金額×（設備折余價值÷設備原值）×適用增值稅稅率
設備折余價值=設備原值-累計已提折舊
設備原值和已提折舊按企業會計核算數據計算。
第十三條 研發機構以假冒采購國產設備退稅資格、既申報抵扣又申報退稅、虛構采購國產設備業務、提供虛假退稅申報資料等手段騙取國產設備退稅款的，按照現行有關法律、法規處理。
第十四條 本辦法由國家稅務總局會同財政部負責解釋。
第十五條 本辦法執行期限為2009年7月1日至2010年12月31日，具體以增值稅專用發票上的開票時間為準。


抄送：財政部、商務部、科技部、海關總署。