第七條 房地產開發企業建造的商品房，已自用或出租使用年限在一年以上再出售的，應按照轉讓舊房及建筑物的政策規定繳納土地增值稅，不再列入土地增值稅清算的范圍。
    第三章 清算申請與受理
    第八條 凡符合應辦理土地增值稅清算條件的納稅人，應在90日內向主管地方稅務機關提出清算稅款申請，并據實填寫《土地增值稅清算申請表》（附件2），經主管地方稅務機關核準后，即可辦理稅款清算手續。納稅人清算土地增值稅申請不符合受理條件的，稅務機關應將不予核準的理由在《土地增值稅清算申請表》中注明并退回納稅人。
    第九條 凡主管地方稅務機關要求納稅人辦理土地增值稅清算手續的房地產開發項目，主管地方稅務機關應出具《土地增值稅清算通知書》（附件3）并送達納稅人。納稅人應在接到《土地增值稅清算通知書》之日起30日內，填寫《土地增值稅清算申請表》報送主管地方稅務機關。
    第十條 納稅人在辦理土地增值稅清算申報手續時，應向主管稅務機關提交有關清稅項目資料，并填寫《土地增值稅清算材料清單》（附件4）。須提交的有關資料如下：
    （一）國有土地使用權證書。
    （二）取得土地使用權時所支付的地價款有關證明憑證及國有土地使用權出讓或轉讓合同。
    （三）項目竣工決算報表、工程合同結算單、項目工程竣工驗收報告。
    （四）商品房購銷合同統計表并加蓋公章，內容包含：銷售項目棟號、房間號、銷售面積、銷售收入、合同簽定日期、用途等。
    （五）能夠按清算項目支付金融機構貸款利息的有關證明及借款合同清單。
    （六）清算項目的銷售許可證。
    （七）與轉讓房地產有關的完稅憑證，包括：已繳納的營業稅、城建稅、教育費附加等。
    （八）已繳納土地增值稅的完稅憑證。
    （九）《土地增值稅清算鑒證報告》。
    （十）《土地增值稅納稅申報表（一）》。
    （十一）稅務機關要求報送的其他與土地增值稅清算有關的證明資料等。
    第十一條 納稅人應準確、據實填寫各類清算申報表和相關表格；納稅人委托稅務中介機構代理進行清算鑒證的，在《鑒證報告》中應詳細列舉清算項目的收入、扣除項目和進行土地增值稅清算的相關鑒證信息。
    第十二條 主管地方稅務機關在收取納稅人提交的申請材料和《鑒證報告》時，應認真核對納稅人提供的資料，并嚴格按照《鑒證報告》標準格式進行驗收。對納稅人提交的申請材料齊全的，主管稅務機關應予以受理，并向納稅人開具《土地增值稅清算受理通知書》（附件5）轉入審核程序。對納稅人提交的清稅資料不完整、《鑒證報告》內容不規范、審計事項情況不清楚的，應退回納稅人重新修改《鑒證報告》或補充資料，并向納稅人開具《土地增值稅清算補充材料通知書》（附件6），待清算資料補充完整后，轉入審核程序。
    第四章 清算審核
    第十三條 主管地方稅務機關應自受理納稅人清算申請之日起90日內完成清算審核工作，不含納稅人應稅務機關要求的補正資料時間。
    第十四條 主管地方稅務機關應認真審核納稅人提供的證明憑證、資料是否齊全；《鑒證報告》的格式是否規范，內容是否齊全；各表格邏輯關系是否正確。
    第十五條　清算項目銷售收入的確定。銷售收入是指銷售商品房所取得的全部價款及有關的經濟收益。
    房地產開發企業將開發產品用于職工福利、獎勵、對外投資、分配給股東或投資人、抵償債務、換取其他單位和個人的非貨幣性資產等，發生所有權轉移時應視同銷售房地產。
    第十六條 對清算項目扣除項目金額的確定，按照《中華人民共和國土地增值稅暫行條例》和《中華人民共和國土地增值稅暫行條例實施細則》的規定計算，對納稅人未取得合法有效憑證的，不予扣除；房地產開發企業的預提費用，除另有規定外，不得扣除。
    第十七條 納稅人扣除項目金額的范圍如下：
    （一）納稅人為取得土地使用權所支付的地價款和按國家統一規定交納的有關費用。