（5）從有關部門和母公司取得的研究開發費專項撥款。企業取得國家財政撥款并納入不征稅收入的研究開發費用，以及從有關部門和母公司取得的研究開發費專項撥款，在計算研發費用加計扣除時應予以剔除。

第二，注意研發項目確認的立項要求。在會計核算層面，研發費用指企業在產品、技術、材料、工藝、標準的研究、開發過程中發生的各項費用。對研發項目的立項基本無門檻，只要企業內部管理層認可就可立項。而稅法規定的稅前可加計扣除的項目，僅限于企業從事《國家重點支持的高新技術領域》和國家發展改革委員會等部門公布的《當前優先發展的高技術產業化重點領域指南》研究開發活動。

第三，申請研發費用加計扣除必須把握3個環節。根據規定，企業享受研究開發費用稅前加計扣除政策一般包括項目確認、項目登記和加計扣除3個環節。具體地說，項目確認環節指企業研究開發的項目需向政府（省轄市、縣及縣級市）以上科技部門或經信委申請項目確認，政府科技部門或經信委進行審核并出具《企業研究開發項目確認書》后，由政府科技部門或經信委等部門連同申請資料一同提交同級主管稅務機關；項目登記環節指稅務機關取得《企業研究開發項目確認書》后，對無異議或不予登記的項目，向企業出具《企業研發項目登記信息告知書》，告知項目登記號或不予登記的原因；加計扣除環節指已取得稅務機關登記并發放《企業研究開發項目登記信息告知書》的企業，享受研究開發費用加計扣除時，應在企業所得稅年度納稅申報前按規定進行備案。在企業所得稅年度納稅申報時，企業對已經登記的研發項目所發生的研發費用享受稅法規定加計扣除優惠政策。

第四，注意報送相關涉稅資料的要求。根據規定，對企業申報研究開發費用加計扣除的資料包括：稅務機關發放的《企業研究開發項目登記信息告知書》，《研究開發項目可加計扣除研究開發費用情況歸集表》，《研究開發費用支出明細表(委托開發項目填報)》；如果是集中開發項目，需同時報送研究開發費決算表、費用分攤表和實際分享收益比例等資料；還有具有資質的中介機構出具的專項鑒證報告。

第五，注意匯繳申報的納稅調整。企業實際發生的研究開發費用，在年度中間預繳申報時，允許據實扣除，在報送稅務機關備案確認后進行年度匯繳申報時，才能對符合稅法要求的研發費進行加計扣除，調減當期應納稅所得額。因此，納稅人在預繳申報時不得自行加計扣除。若納稅調整后的所得小于零，其因享受加計扣除而形成的虧損額或擴大的虧損額，可以按稅法規定在其后的5年內進行彌補。