在研發費用的審核標準上，新《辦法》中要求擁有核心關鍵技術，并以此為基礎開展經營活動，且當年度的研究開發費用總額占企業銷售（營業）收入總額的比例不低于6%；其中，企業在中國境內發生的研究開發費用金額占研究開發費用總額的比例不低于60%。

　　二、其他需要關注的內容

　　軟件企業認定實行年審制度。未年審或年審不合格的企業，即取消其軟件企業的資格，軟件企業認定證書自動失效，不再享受有關鼓勵政策。2011年1月1日前完成認定的軟件企業，在享受企業所得稅優惠政策期滿前，仍按信部聯產[2000]968號文的認定條件進行年審，優惠期滿后按照本辦法重新認定，但不再享受財稅[2012]27號文第三條規定的兩免三減半優惠政策。

　　工業和信息化部在部門戶網站和“中國雙軟認定網”上對省級主管部門報送的經認定的軟件企業名單公示7個工作日，沒有異議的，予以備案。有異議的，工業和信息化部不予備案，發回報送的省級主管部門重新審核。

　　軟件企業認定證書由工業和信息化部統一印制，正本和副本各一份。